Cre小鼠和Flox小鼠是科学研究中常用的两种转基因小鼠模型，主要用于研究基因在特定组织、细胞或时间点的功能。共同构建了Cre/loxP系统，为一种高效的基因编辑工具。

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1. Cre小鼠：携带Cre重组酶基因的转基因小鼠。Cre重组酶是一种特异性DNA重组酶，源自噬菌体P1，能够识别DNA上的loxP位点并进行重组。除了Cre外，这类重组酶还有FIp和Dre（D6特异性重组酶）。Cre基因通常通过一个特定的启动子驱动，以在特定组织或细胞中表达。

2. Flox小鼠：携带目标基因两侧插入了loxP位点的转基因小鼠（Flox是“flanked by loxP”的缩写）。这些loxP位点为Cre酶的作用提供靶标。loxP位点本身不会影响目标基因的功能，目标基因可以正常表达。

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我们知道loxP位点是一个34bp的短DNA序列，包括两个反向重复序列和一个核心序列。核心序列决定重组事件的方向性。在同一个 DNA 分子上，根据Lox位点的位置与方向，可能会发生3种不同的重组事件：

①  如果loxP位点的方向相同：Cre酶介导两者之间的DNA片段缺失。

②  如果loxP位点方向相反：Cre酶介导片段的倒位（翻转）。

③  如果loxP位点在不同染色体或远端区域：Cre酶介导片段的交换（基因易位）。

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1. 基因敲除：Cre酶在全身所有组织表达，导致Flox基因的全身敲除。也可实现条件性敲除：

即Cre酶在特定组织或时间点表达，实现特定组织或发育阶段的基因敲除。

2. 基因功能研究：通过观察目标基因敲除后的表型变化，研究基因的功能。

3. 疾病模型建立：模拟人类疾病的特定基因突变，研究疾病机制或筛选药物。

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1肝脏特异性基因敲除：Cre小鼠：携带肝脏特异性启动子（Alb）的Cre基因；Flox小鼠：目标基因两侧插入loxP位点。这样可以使目标基因仅在肝脏被敲除，其他组织不受影响。比如：Alb-CreERT2小鼠

2神经系统研究：Cre小鼠：以Nestin（神经元特异性启动子）驱动Cre酶表达；Flox小鼠：携带与神经疾病相关的基因。可以研究目标基因对神经系统发育或疾病的影响。

3.     时间特异性基因敲除：Cre小鼠：携带诱导型Cre重组酶（如ER-Cre）基因，需激活剂（如他莫昔芬）诱导表达；Flox小鼠：携带目标基因。目标基因可在指定时间点敲除。

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一般利用Reporter小鼠与Cre小鼠杂交来验证Cre的表达谱。Reporter小鼠一般是在Rosa26位点插入带有lox-stop-lox终止盒以及报告基因（LSL-R）的一种工具小鼠，只有Cre酶介导重组切除终止盒后，才会有报告基因的表达。

例如需要验证GeneX-Cre定点整合小鼠，可将Cre杂合子小鼠（GeneXCre/wt）与Reporter杂合子（Reporterlox/wt）或纯合子（Reporterlox/lox）小鼠交配，通过免疫组化、免疫荧光或原位杂交来判断Cre阳性的子代小鼠(GeneXCre/wt ; Reporter lox/wt)报告基因是否在已知表达GeneX的细胞中表达，从而了解Cre的特异性表达是否与预期的一致。

在后期的科研中，通过改进Cre/loxP系统可开发更高效、更低毒性的Cre酶。也可以通过引入更精准的组织特异性启动子。再者，与CRISPR/Cas9技术结合，可实现更灵活的基因编辑。在癌症、神经退行性疾病、代谢性疾病等领域，Cre/loxP系统将继续发挥重要作用，推动基因治疗与药物研发通过Cre小鼠和Flox小鼠的联合使用，能够精确控制基因表达，实现复杂的基因功能解析和疾病建模，成为现代生命科学研究中的重要工具。