研究药物的小伙伴们在证明了某药物对某种疾病模型的有效作用后，迫切需要找一条通路/基因/lncRNA以揭示药物机制，例如：姜黄素通过作用于长链非编码RNA***来改善***疾病。D-lnc数据库全面收录了已发表文献中报道的药物对lncRNA的调控作用，并通过全面检索cMap和GEO数据库，经芯片重注释等生物信息学手段分析了某些药物对lncRNA表达量的调控。且该网站的一大亮点是，基于相似结构的小分子药物影响相似结构的lncRNA的假设，若用户提供lncRNA的FASTA格式的序列或者提供小分子药物结构MOL，能够预测可能受某药物影响的lncRNA，或预测出lncRNA受哪些药物调控。
D-lnc网址：http://www.jianglab.cn/D-lnc/index.jsp
1
检索某药物作用的lncRNA
可选择搜索“既往实验验证过的”和“生信分析得出的”两大块进行检索
在species中可选择人、大鼠、小鼠、斑马鱼、摇蚊
以curcumin检索lncRNA结果如下
点击more可看到该lncRNA是上调还是下调，是实验验证的还是生信预测的，具体报道的文章名称，具体实验条件等详细信息
1
检索调控某lncRNA的药物
以H19为例，检索结果如下：
1
基于序列相似性的预测结果
在Analysis部分（种属：人）的文本框中输入H19的FASTA格式的序列
点击analysis后，可呈现出与H19具有相似序列的lncRNA的列表
点击列表右侧的搜索按钮可出现预测的药物，例如我们点击第二个，显示出的PDIA5与H19具有相似的序列，已被证明可调控PDIA5的Panobinostat则很有可能也可以调控H19的表达。
此外还可以根据药物结构进行检索，输入示例他莫昔芬的MOL结构，点击analysis，出现4个与他莫昔芬药物结构相似的小分子药物
例如我们点击第三个beta-Asarone右侧的搜索符号
结果显示，MALAT1也可能受他莫昔芬的调控
|
